在海鮮苗運輸前，尤其是長距離運輸，事先要制定詳細的運輸計劃，包括運輸容器、交通工具、人員組織以及中途換水等事項，若是托運，還需算好運抵時間，以便通知接貨人準時接貨。
2.海鮮苗用水
    運輸海鮮苗的用水，只要是無污染、水質清新的河水、井水或水庫水均可，要求水溫必須與魚苗養殖池水溫基本一致，如采用自來水，可適當除氯后再使用。在運輸中要隨時注意溫度變化，作適宜的升溫或降溫準備。
3.海鮮苗適時停食
    對要起運的海鮮苗，要求選擇體質健壯、無病無傷的海鮮苗，嚴格用篩子篩好海鮮種，剔除野雜，保證規格一致。提前1天～3天養在新水中，在裝運前兩天停止喂食，這樣可使海鮮苗體內的糞便排除干凈，降低魚苗的代謝率，以免排入運輸容器中污染水質。另外，混養的海鮮苗此時要分開飼養，以方便裝運。有條件的地方最好運輸前一天進行拉網密集鍛煉，加快海鮮苗糞便的排泄和增強海鮮苗的抗應激能力，為運輸創造更有利的條件。
4.選好運輸方法
    常用的海鮮苗運輸方法有兩種：
    (1) 短距離運輸，通常運輸時間在一天以內，可直接使用百樂源海鮮苗呼吸塑料袋運輸。
(2) 長距離運輸，一般運輸時間在2天以上，可使用百樂源海鮮苗呼吸塑料袋運輸（能達到5-9天，可運輸多種海鮮苗）或活魚海鮮運輸車運輸（運輸品種單一）。
5.用百樂源海鮮苗呼吸袋裝運時，呼吸袋的盛水量（連海鮮苗一起）約為袋總容量的2/5～1/2。使水量過多，減少了空氣的空間，容易造成缺氧，并增加了運輸重量；水太少，則裝海鮮苗量也少。袋中用水必須清潔，以減少有機物對氧氣的消耗。當水和海鮮苗放入袋后，（因百樂源海鮮苗呼吸袋具有透氣不透水的物理特性，可自由進行氣體交換，本產品還可以釋放負離子，殺菌抑菌，保持水質不變）用棉紗線或橡皮筋扎緊袋口密封。為了防止呼吸袋在運輸途中損壞，可將呼吸袋裝入塑料周轉箱（注意不要把呼吸袋扎破）、木箱或泡沫塑料箱（需要打孔）里。呼吸袋裝運海鮮苗（種）的密度，與運輸時間、溫度、海鮮體大小、體質和鍛煉程度等有密切關系，要根據具體情況酌情處理。